– изучение сырьевой базы рыбного промысла и проведение государственного мониторинга водных биоресурсов и среды их обитания;
– разработка перспективных направлений развития аквакультуры и искусственного воспроизводства водных биоресурсов;
– оценка экологического состояния водных объектов по комплексу гидрохимических и гидробиологических показателей;
– оценка размеров вреда, причиненного водным биоресурсам хозяйственной деятельностью;
– оценка эффективности рыбозащитных устройств на водозаборах гидротехнических сооружений;
– изучение состояния популяций редких и уязвимых видов водных организмов, разработка мер по их сохранению;
– использование геоинформационных технологий в научно-исследовательской деятельности;
– консультативная помощь органам рыбоохраны, правоохранительным органам и государственным структурам по вопросам сохранения водных биоресурсов и среды их обитания;
– организация и проведение научных встреч по проблемам водных экосистем; научные консультации и творческое сотрудничество.