– изучение сырьевой базы рыбного промысла и проведение государственного мониторинга водных биоресурсов и среды их обитания;

– разработка перспективных направлений развития аквакультуры и искусственного воспроизводства водных биоресурсов;

– оценка экологического состояния водных объектов по комплексу гидрохимических и гидробиологических показателей;

– оценка размеров вреда, причиненного водным биоресурсам хозяйственной деятельностью;

– оценка эффективности рыбозащитных устройств на водозаборах гидротехнических сооружений;

– изучение состояния популяций редких и уязвимых видов водных организмов, разработка мер по их сохранению;

– использование геоинформационных технологий в научно-исследовательской деятельности;

– консультативная помощь органам рыбоохраны, правоохранительным органам и государственным структурам по вопросам сохранения водных биоресурсов и среды их обитания;

– организация и проведение научных встреч по проблемам водных экосистем; научные консультации и творческое сотрудничество.